More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1715 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  100 
 
 
324 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  52.08 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  50.98 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  38.03 
 
 
303 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 
303 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 
303 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 
303 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  37.38 
 
 
303 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  38.36 
 
 
303 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  38.69 
 
 
303 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  37.05 
 
 
303 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 
311 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 
303 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  37.05 
 
 
303 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  37.38 
 
 
303 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  35.6 
 
 
310 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  35.28 
 
 
310 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  35.92 
 
 
310 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.41 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  34.08 
 
 
307 aa  194  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
306 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
306 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  36.22 
 
 
310 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  37.01 
 
 
303 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  34.74 
 
 
304 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.92 
 
 
315 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 
306 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  34.08 
 
 
308 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
305 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.49 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  37.05 
 
 
303 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  35.46 
 
 
311 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  34.43 
 
 
306 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  35.99 
 
 
303 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
315 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 
302 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  35.62 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 
308 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  36.8 
 
 
311 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
302 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.51 
 
 
307 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  34.51 
 
 
305 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  35.69 
 
 
310 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.33 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
311 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
315 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  33.22 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.15 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  34.21 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 
319 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 
310 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 
311 aa  159  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 
300 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  35.1 
 
 
332 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.96 
 
 
318 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 
310 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  33.66 
 
 
310 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 
338 aa  156  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  33.66 
 
 
310 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 
312 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  36.91 
 
 
326 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
313 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  31.72 
 
 
310 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.45 
 
 
319 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  36.2 
 
 
312 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 
315 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.45 
 
 
319 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  33.92 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  33.78 
 
 
310 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  35.57 
 
 
311 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  34.64 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  31.35 
 
 
320 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  34.55 
 
 
310 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  28.75 
 
 
310 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 
311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.64 
 
 
350 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
309 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
309 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
330 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  33.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  33.11 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  33.11 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  33.45 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>