More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0383 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 312 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  79.17 
 
 		 312 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  76.92 
 
 		 312 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  50.8 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  55.16 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  49.19 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  50 
 
 		 322 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  49.52 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  52.29 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  47.1 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  46.62 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  50.33 
 
 		 319 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  45.16 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  50.33 
 
 		 473 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  48.52 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  50 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 449 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  50.37 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  45.85 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  45.85 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  45.31 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  41.45 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  43.93 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  43.28 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  44.85 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  42.95 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  42.62 
 
 		 309 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  42.62 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  42.76 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  38.51 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  38.11 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  38.41 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 333 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.67 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.37 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.05 
 
 		 307 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  36.51 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  36.79 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.04 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.87 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  37.92 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.37 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  36.03 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.08 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.38 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.33 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.73 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  35.79 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  30.72 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.08 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  31.63 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.59 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>