More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0641 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  100 
 
 
311 aa  620  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  65.37 
 
 
315 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  40.38 
 
 
311 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.31 
 
 
312 aa  203  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 
310 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  40.07 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  39.72 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  38.03 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  36.75 
 
 
322 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  38.33 
 
 
308 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  38.91 
 
 
308 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  38.52 
 
 
315 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 
323 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  38.16 
 
 
314 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 
326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33.98 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 
325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 
324 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.98 
 
 
305 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  35.08 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.46 
 
 
324 aa  179  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  34.18 
 
 
316 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
313 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  33.66 
 
 
310 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
315 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  37.79 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  36.94 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  37.83 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  36.54 
 
 
306 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  35.34 
 
 
313 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  38.17 
 
 
312 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.59 
 
 
313 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
312 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  36.68 
 
 
304 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
317 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  35 
 
 
318 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 
303 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  34.48 
 
 
318 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 
306 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  36.24 
 
 
313 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.55 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  35.77 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.87 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  36.47 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  36.47 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  36.47 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  37.83 
 
 
313 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  33.33 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  35.35 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 
312 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.3 
 
 
315 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.49 
 
 
307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  35.65 
 
 
327 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  37.93 
 
 
308 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.17 
 
 
307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  35.6 
 
 
303 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 
310 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  35.06 
 
 
302 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 
302 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
307 aa  156  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 
300 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.63 
 
 
303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.55 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.63 
 
 
303 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
318 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
310 aa  152  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  34.04 
 
 
303 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  36.52 
 
 
303 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  31.83 
 
 
318 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.56 
 
 
303 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 
318 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.92 
 
 
303 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.92 
 
 
303 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.92 
 
 
303 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 
318 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 
303 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  34.28 
 
 
303 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 
303 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.34 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>