More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2334 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 314 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  90.65 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  53.67 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  48.34 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  40.52 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  44.23 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  42.48 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  43.69 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  40.76 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  40.39 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  39.24 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  39.61 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.83 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  35.83 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  35.83 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  35.83 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  39.4 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35.83 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  38.51 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  35.83 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  35.83 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  40.32 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  35.83 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  36.04 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  35.5 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  39.68 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  41.37 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  37.82 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  36.68 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  39.09 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 449 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  38.26 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.2 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.74 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.55 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.55 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.65 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  36.3 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  28.34 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.64 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  29.71 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.94 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34.1 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.92 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  30.88 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.4 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.23 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.87 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.44 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  35.79 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  27.12 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  31.97 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>