More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0693 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 310 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  79.74 
 
 		 310 aa  487  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  41.44 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.59 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.22 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.55 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.22 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  33.44 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  33.44 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.71 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  29.8 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.02 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.84 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.37 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.71 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  29.34 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  36.84 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.28 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  27.33 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  28.94 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  31.91 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  31.82 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  31.82 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  31.82 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  31.58 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  31.82 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  31.82 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  28.77 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  31.58 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  31.58 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  31.58 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  31.58 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  31.25 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  31.25 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.89 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.19 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.91 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  34.1 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.71 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  34.48 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  27.56 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.99 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  28.82 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  32.45 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  27.69 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.3 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  23.87 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  27.78 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.21 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  30.46 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  26.92 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  35.67 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28.82 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  32.61 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  33.72 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  28.08 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  27.78 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>