287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0095 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  82.46 
 
 
328 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  70.68 
 
 
325 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  70.68 
 
 
325 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  70.37 
 
 
325 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  54.37 
 
 
321 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  53.65 
 
 
318 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  51.1 
 
 
344 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  50.76 
 
 
332 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  54.55 
 
 
323 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  48.31 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  48.57 
 
 
318 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  47.3 
 
 
308 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.83 
 
 
325 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  46.62 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  44.55 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  44.79 
 
 
316 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  42.32 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  43.51 
 
 
325 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 
336 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  43.12 
 
 
328 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  39.94 
 
 
333 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  40.06 
 
 
315 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.32 
 
 
316 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
310 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.86 
 
 
317 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.22 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 
318 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  36.5 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
303 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  36.99 
 
 
315 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.1 
 
 
315 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.92 
 
 
323 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.46 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  40.29 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  32.42 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  40.29 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.22 
 
 
313 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.54 
 
 
312 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.58 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.85 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  33.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  37 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  35.02 
 
 
315 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 
308 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
322 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.62 
 
 
306 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
312 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.99 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.1 
 
 
307 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 
311 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
315 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.35 
 
 
302 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 
308 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  35.59 
 
 
315 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 
308 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 
313 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  30.61 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  30.86 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.75 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 
312 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  38.32 
 
 
318 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.77 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  26.17 
 
 
305 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 
314 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  35.38 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  26.69 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>