More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1440 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  98.71 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  92.53 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  92.53 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  92.21 
 
 		 309 aa  590  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  92.53 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  92.53 
 
 		 309 aa  590  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  92.53 
 
 		 309 aa  590  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  92.53 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  92.53 
 
 		 309 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  92.53 
 
 		 309 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  81.61 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  42.21 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  43.46 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  40.07 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  40.39 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  41.59 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  42.95 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  41.61 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  40.73 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  40.73 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  40.73 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  40.84 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  41.64 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  39.55 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  38.64 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  43 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  41.45 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  42.36 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  38.13 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  39.58 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  37.29 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  38.31 
 
 		 442 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  37.99 
 
 		 473 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  37.99 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  36.77 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  39.22 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  36.07 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 324 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.69 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.01 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  36.01 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  30.33 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  30.33 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.03 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  34.8 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  27.67 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.24 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.37 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.56 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  27.67 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  28 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  28 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  28 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.08 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.78 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  31.37 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  29.11 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.58 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.88 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>