More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1834 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  613  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  68.51 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  61.94 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  37.79 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  40.13 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  39.47 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  37.1 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  37.1 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  36.45 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.67 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  33.33 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  34.75 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.63 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  34.43 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  34.43 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  34.43 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  34.75 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  34.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.54 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 303 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  33.89 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  31.72 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  32.56 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  32.34 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  32.8 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  35 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.31 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  32.33 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.03 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  30.19 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.47 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  29.22 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.34 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  31.12 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  35.76 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  31.77 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  29.74 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  30.72 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  33.1 
 
 		 313 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  30.15 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  31.97 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.03 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  32 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  31.09 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  29.64 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  28.8 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.8 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>