296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0078 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  100 
 
 
308 aa  610  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  46.77 
 
 
310 aa  288  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  43.55 
 
 
310 aa  275  8e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  43.55 
 
 
311 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  42.26 
 
 
310 aa  258  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  42.26 
 
 
310 aa  258  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  43.71 
 
 
286 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  38.71 
 
 
307 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  37.1 
 
 
307 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  32.05 
 
 
318 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 
306 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  33.44 
 
 
310 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.48 
 
 
315 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  29.84 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
311 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  35.37 
 
 
304 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.48 
 
 
316 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 
302 aa  158  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.15 
 
 
303 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.91 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 
306 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 
303 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  31.88 
 
 
313 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  37.34 
 
 
306 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  37.24 
 
 
303 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.83 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.73 
 
 
303 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
311 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 
315 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.7 
 
 
310 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  31.3 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
304 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.38 
 
 
310 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 
306 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.99 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.82 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.31 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 
314 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 
315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.01 
 
 
308 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 
308 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.96 
 
 
311 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  29.38 
 
 
308 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 
315 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.07 
 
 
303 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  32.09 
 
 
306 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 
317 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
302 aa  135  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.43 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
310 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  27.45 
 
 
312 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
305 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  28.32 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  28.17 
 
 
314 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  29.02 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  26.8 
 
 
350 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 
332 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 
323 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  29.5 
 
 
303 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  30.28 
 
 
319 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
312 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 
326 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 
315 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.03 
 
 
324 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  25.52 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  31.18 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 
319 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  25 
 
 
312 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  31.47 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  28.21 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 
332 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  32.01 
 
 
302 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  27.54 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  26.52 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30.15 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  26.52 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  27.78 
 
 
311 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>