More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2650 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  100 
 
 
303 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  68.98 
 
 
303 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  53.64 
 
 
303 aa  338  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  53.64 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  53.31 
 
 
303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  52.98 
 
 
303 aa  334  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  53.64 
 
 
303 aa  333  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  52.65 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  48.34 
 
 
306 aa  299  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  48.01 
 
 
306 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  45.67 
 
 
306 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  45.67 
 
 
306 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  45.67 
 
 
306 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  47.85 
 
 
303 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  48.51 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  43.28 
 
 
308 aa  262  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  45.03 
 
 
307 aa  259  3e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  43.05 
 
 
302 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  41.67 
 
 
304 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  45.54 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  43.64 
 
 
300 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 
305 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  40.2 
 
 
305 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  40.47 
 
 
302 aa  222  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 
338 aa  218  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  37.05 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  41.07 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  38.49 
 
 
316 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  37.62 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 
310 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  39.04 
 
 
315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  38.7 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  36.24 
 
 
307 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
309 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  37.1 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  38.68 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  36.24 
 
 
307 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 
315 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  37.25 
 
 
315 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
312 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  35.21 
 
 
308 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.68 
 
 
311 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
315 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.05 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  35.34 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  31.69 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.95 
 
 
310 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  34.63 
 
 
310 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33 
 
 
310 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 
310 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  33.33 
 
 
308 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  35.29 
 
 
315 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  37.04 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  33.45 
 
 
310 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.7 
 
 
306 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  34 
 
 
311 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.9 
 
 
306 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  36.93 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
314 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  32.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  36.79 
 
 
316 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 
308 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 
311 aa  149  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  29.62 
 
 
311 aa  149  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  34.73 
 
 
325 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 
318 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  34.03 
 
 
310 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  36.24 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  36.06 
 
 
328 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  36.12 
 
 
310 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
318 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  37.37 
 
 
303 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  36.23 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 
319 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.82 
 
 
319 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
318 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
330 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.8 
 
 
308 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  39.53 
 
 
326 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 
310 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  38.57 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  36.95 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  35.39 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  35.84 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 
325 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  35.03 
 
 
318 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.94 
 
 
315 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  33.72 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  33.72 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>