More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4520 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  56.68 
 
 		 326 aa  334  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  54.55 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  55.81 
 
 		 312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  55.7 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  55.05 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  57 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  57 
 
 		 442 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  56.68 
 
 		 473 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  57 
 
 		 442 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  57 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  56.68 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  48.86 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  46.77 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  46.58 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  46.89 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  48.54 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  40.78 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  42.67 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  42.67 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  41.78 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  41.81 
 
 		 332 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  44.66 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  36.84 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  40.26 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  41.2 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  36.12 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  37.54 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  36.89 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  36.89 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  36.89 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  36.89 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  37.22 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  36.57 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  39.49 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.64 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  37.72 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.99 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  37.72 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.88 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.3 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.28 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.14 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.28 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.79 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.14 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  28.99 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.79 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  38.99 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.01 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.56 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  30.11 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.06 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.12 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.92 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.43 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  33.11 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  34.49 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.97 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  36.39 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.68 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.78 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>