More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0565 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  100 
 
 
306 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  97.39 
 
 
306 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  54.64 
 
 
303 aa  348  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  54.3 
 
 
303 aa  348  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  54.3 
 
 
303 aa  348  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  54.3 
 
 
303 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  345  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  53.97 
 
 
303 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  54.3 
 
 
303 aa  342  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  52.32 
 
 
303 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  52.32 
 
 
303 aa  334  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  49.01 
 
 
303 aa  296  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  49.17 
 
 
303 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  49.01 
 
 
303 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  48.01 
 
 
303 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  44.55 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  48.36 
 
 
300 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  44.41 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  45.39 
 
 
308 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  43.2 
 
 
306 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  43.2 
 
 
306 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  41.16 
 
 
306 aa  255  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  43.09 
 
 
305 aa  255  8e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  43.75 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  44.88 
 
 
307 aa  245  6e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  42.21 
 
 
310 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  40.94 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  45.39 
 
 
302 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  42.57 
 
 
304 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  39.56 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  38.06 
 
 
310 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  39.87 
 
 
311 aa  188  9e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 
308 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  37.74 
 
 
310 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 
310 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  40.15 
 
 
308 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  36.21 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.19 
 
 
307 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.57 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
311 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  38.92 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.72 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  36.82 
 
 
315 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.45 
 
 
314 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  35.99 
 
 
318 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
318 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.66 
 
 
310 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
318 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  34.72 
 
 
313 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 
308 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.87 
 
 
315 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
314 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 
308 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 
316 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  36.92 
 
 
310 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
330 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
326 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 
318 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
336 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
305 aa  152  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  31.78 
 
 
315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
308 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  30.57 
 
 
316 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 
310 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
320 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  31.88 
 
 
313 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
313 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  32.83 
 
 
318 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  35.07 
 
 
310 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
311 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 
309 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  32.81 
 
 
312 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  36.49 
 
 
313 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  35.52 
 
 
310 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  35.52 
 
 
310 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  34.23 
 
 
312 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  31.27 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  29.21 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 
317 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 
313 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
325 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  30.8 
 
 
306 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  30.47 
 
 
312 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 
312 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 
311 aa  142  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  28.19 
 
 
324 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  32.28 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>