282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2176 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 325 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  62.34 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  55.13 
 
 		 313 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  52.2 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  50.97 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  45.81 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.91 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  46.47 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  44.86 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  43.42 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  45.87 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  41.14 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  42.36 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  46.1 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  46.1 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  46.1 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  41.38 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  42.67 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  37.33 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  41.62 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.8 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  41.51 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  40.87 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.8 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.52 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  37.25 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  36.95 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.91 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  37.25 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  38.61 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  31.65 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  33.59 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  32.75 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  37.63 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  37.28 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  41.89 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.7 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  37.28 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  34.08 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  37.59 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  41.32 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  36.03 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  36.21 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  32.4 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  36.29 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  41.67 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  34.89 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  36.5 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  34.48 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  37.36 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  35.37 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  35.45 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 449 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.66 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  37.26 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  38.58 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  35.31 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>