More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1069 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  36.22 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  36.98 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.53 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  36.57 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  39.85 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.55 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  35.76 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  35.76 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  36.54 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.07 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.49 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  34.94 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  32.01 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  35.19 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.47 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.52 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.76 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.76 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.07 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  32.59 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.41 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  30.41 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  32.17 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  30.87 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  32.2 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  31.62 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  31.06 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  31.85 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  31.85 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  31.85 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.2 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  31.85 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  31.85 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  28.21 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  31.27 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  31.27 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  28.25 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  31.27 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>