More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1268 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  100 
 
 
314 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  36.14 
 
 
303 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  36.15 
 
 
323 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  34.86 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  40.78 
 
 
308 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 
310 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.15 
 
 
310 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  35.74 
 
 
310 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  38.43 
 
 
313 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.13 
 
 
308 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  35.4 
 
 
310 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  34.1 
 
 
303 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  40.23 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  35.31 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
325 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 
303 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  35.07 
 
 
306 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.56 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 
306 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
303 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 
306 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  35.66 
 
 
303 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.72 
 
 
322 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 
315 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 
305 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 
318 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.26 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 
317 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  36.77 
 
 
315 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  36.12 
 
 
330 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  34.6 
 
 
311 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  33.22 
 
 
311 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 
325 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
314 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  37.34 
 
 
314 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  34.63 
 
 
304 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.49 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.3 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.15 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
303 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 
307 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.19 
 
 
326 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  37.03 
 
 
315 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  37.03 
 
 
318 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 
308 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.1 
 
 
313 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 
305 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  37.63 
 
 
350 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  36.74 
 
 
313 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 
319 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 
320 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  31.6 
 
 
319 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.7 
 
 
315 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  37.42 
 
 
327 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.22 
 
 
304 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  38.77 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.13 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 
442 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  39.33 
 
 
442 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 
449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.45 
 
 
315 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.99 
 
 
302 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.21 
 
 
316 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 
312 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  37.06 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  38.35 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.97 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>