279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D04 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  60.49 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  59.44 
 
 
310 aa  351  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  59.44 
 
 
310 aa  351  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  58.04 
 
 
310 aa  338  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  49.3 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  43.71 
 
 
308 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  39.65 
 
 
307 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  39.65 
 
 
307 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  41.03 
 
 
308 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  38.54 
 
 
310 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  37.85 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  36.01 
 
 
318 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  40.83 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  32.75 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  35.19 
 
 
311 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
303 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  37.68 
 
 
306 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 
303 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 
303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  35.02 
 
 
310 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 
306 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  34.66 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.07 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.07 
 
 
315 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.68 
 
 
316 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  35 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 
306 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 
306 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.36 
 
 
324 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
308 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.13 
 
 
308 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 
305 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
302 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 
313 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  33.07 
 
 
302 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  29.72 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.05 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  32.85 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  35.17 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.93 
 
 
310 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 
306 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.16 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.96 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  31.91 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.41 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  28.46 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  30 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 
317 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  30.62 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  32.32 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  31.18 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 
318 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 
324 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  32.38 
 
 
325 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
328 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.97 
 
 
313 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  29.36 
 
 
306 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  31.47 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  31.93 
 
 
318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  33.47 
 
 
311 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  32 
 
 
333 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  30.69 
 
 
311 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 
315 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  25.99 
 
 
313 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  28.21 
 
 
311 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  30.6 
 
 
353 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  27.21 
 
 
311 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 
328 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  27.31 
 
 
312 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  29.64 
 
 
312 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  26.13 
 
 
312 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  29.54 
 
 
310 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  30.12 
 
 
332 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
315 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
314 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  28.47 
 
 
312 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>