More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1968 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  99.68 
 
 
309 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  99.68 
 
 
309 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  99.68 
 
 
309 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 
309 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 
309 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 
309 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 
309 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  99.03 
 
 
309 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  92.21 
 
 
310 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  91.88 
 
 
310 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  91.88 
 
 
310 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  92.21 
 
 
310 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  91.88 
 
 
310 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  80.26 
 
 
310 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  43.61 
 
 
311 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  43 
 
 
319 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  41.69 
 
 
311 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  41.69 
 
 
311 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  42.26 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  40.4 
 
 
324 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  40.4 
 
 
324 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  40.4 
 
 
324 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  41.94 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  42.62 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  41.23 
 
 
326 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  39.81 
 
 
311 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  40.98 
 
 
312 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 
312 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  37.1 
 
 
332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  41.12 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  41.37 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  41.08 
 
 
316 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  39.93 
 
 
312 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  37.12 
 
 
322 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 
310 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 
310 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
319 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  38.64 
 
 
442 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
442 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
449 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
313 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
473 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  35.83 
 
 
314 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 
314 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  39.87 
 
 
312 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  36.07 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 
334 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 
314 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.36 
 
 
311 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  37.99 
 
 
325 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
316 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 
306 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 
307 aa  142  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 
306 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.67 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35 
 
 
319 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35 
 
 
319 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.37 
 
 
312 aa  138  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33 
 
 
310 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30 
 
 
306 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
311 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.41 
 
 
306 aa  133  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 
315 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  35.87 
 
 
333 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 
336 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.33 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 
324 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  28 
 
 
303 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  34.12 
 
 
328 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 
305 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.23 
 
 
315 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  35.27 
 
 
308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
311 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
303 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  35.41 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.42 
 
 
314 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 
323 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  28.77 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>