294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2218 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  55.17 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  54.37 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  53.77 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  53.77 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  53.77 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  56.92 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  50.31 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  47.87 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  44.97 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  46.2 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  43.42 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  41.57 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  47.02 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  44.14 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  44.44 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  42.54 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.11 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.15 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  37.74 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  35.56 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  36.86 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  34.27 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.77 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  34.16 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.86 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  32 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.85 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.53 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  29.35 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  34.35 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.92 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.06 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  32.14 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  32.14 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  37.29 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  32.47 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  32.47 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  32.47 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  32.14 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  32.14 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.19 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  32.47 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  33.44 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  35.87 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  33.12 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  36.8 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  26.73 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.17 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.99 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  33.12 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  33.12 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  36.06 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  32.79 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  26.62 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33.84 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.12 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>