More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1787 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 328 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  99.09 
 
 		 328 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  84.15 
 
 		 328 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  55.21 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  53.65 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  53.82 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  51.88 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  52.32 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  51.32 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  53.67 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  52.63 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  53.27 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  48.99 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  46.13 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  47.45 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  42.11 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  42.24 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  41.88 
 
 		 312 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  43.37 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  41.67 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  41.61 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  41.61 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  40.91 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  42.55 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  40.58 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  43.04 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  40.39 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  41.24 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  41.24 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  41.24 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  43.51 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  43.16 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  40.66 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  41.04 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  35.06 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  39.74 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.07 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  37.81 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  37.9 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.32 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  34.74 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  39.64 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.79 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  40.36 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.63 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.1 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.79 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  40.07 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.77 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  34.26 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.03 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  31.78 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.04 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.75 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.6 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>