More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0700 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0700  PfkB  100 
 
 		 322 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  48.72 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  48.72 
 
 		 312 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  50 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  44.95 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  47.16 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  44.3 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  44.63 
 
 		 311 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  46.6 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  43.33 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  46.25 
 
 		 442 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 449 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  43 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  40.78 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  45.93 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  40.78 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  44.74 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  41.86 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  39.94 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  38.74 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  42.62 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  37.95 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  39.16 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  38.13 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  38.13 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  38.13 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  38.13 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  38.13 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  38.74 
 
 		 339 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  36.79 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  36.79 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  37.12 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  37.21 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  37.12 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  37.12 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  36.79 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  37.12 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  36.79 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.87 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.55 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  36.21 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.72 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.39 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  36.68 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  36.68 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  36.79 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.7 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.74 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  32.78 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  32.78 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  32.4 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.94 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  26.45 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.62 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  34.74 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.73 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  29.13 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  32.1 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  26.05 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  27.45 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  24.52 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>