More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1394 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  73.7 
 
 
315 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  61.79 
 
 
332 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  64.67 
 
 
339 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  60.8 
 
 
324 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  60.8 
 
 
324 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  60.8 
 
 
324 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  49.34 
 
 
312 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  45.42 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  47.19 
 
 
320 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  42.48 
 
 
311 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  43.14 
 
 
311 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  44.33 
 
 
312 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  44.55 
 
 
350 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  43.93 
 
 
312 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  43.62 
 
 
319 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  40.27 
 
 
332 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  43.61 
 
 
312 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  42.95 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  40.72 
 
 
326 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  39.47 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  37.5 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  39.93 
 
 
310 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  39.93 
 
 
310 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  46.24 
 
 
449 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  46.24 
 
 
442 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  46.24 
 
 
442 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  46.24 
 
 
319 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  46.24 
 
 
313 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  45.35 
 
 
473 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  41.21 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  36.51 
 
 
322 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  38.96 
 
 
334 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
309 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  37.62 
 
 
310 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  37.29 
 
 
310 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  37.29 
 
 
310 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  40.79 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  38.91 
 
 
316 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  36.36 
 
 
310 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  40.22 
 
 
314 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  40.22 
 
 
314 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
314 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.68 
 
 
307 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.67 
 
 
310 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
310 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.69 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  38.8 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.88 
 
 
310 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 
309 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 
326 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
325 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.99 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  32.44 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  32.44 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.96 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.1 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  38.15 
 
 
316 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 
316 aa  125  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  38.73 
 
 
308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  35.02 
 
 
333 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 
318 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
306 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.98 
 
 
324 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.67 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.76 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
311 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  27.54 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  28.11 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  35.52 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  31.06 
 
 
310 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  31.06 
 
 
310 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  35.06 
 
 
318 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.21 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.59 
 
 
316 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 
310 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.37 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 
315 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  36.39 
 
 
327 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  32.64 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  26.86 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  28.95 
 
 
310 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>