32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00450 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00450  expressed protein  100 
 
 
436 aa  890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.98204  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02840  host-pathogen interaction-related protein, putative  31.48 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.674876  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01919  pfkB family carbohydrate kinase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_4G09500)  30.52 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0083327 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00998  PfkB family carbohydrate kinase (Mak32), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12750)  30.52 
 
 
372 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269478  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30650  Protein necessary for structural stability of L-A double-stranded RNA-containing particles  28.28 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0154701  normal  0.395285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  26.53 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  24.29 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  24.75 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  22.04 
 
 
303 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  35.71 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  25.15 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  21.47 
 
 
305 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  25.14 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  21.14 
 
 
308 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  29.2 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  22.36 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  22.22 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  25.9 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  24.08 
 
 
303 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  29.92 
 
 
303 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  26.79 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  26.67 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  27.07 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.27 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  32.79 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92711  predicted protein  24.45 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26.06 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  22.96 
 
 
305 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  26.86 
 
 
314 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
674 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>