108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2445 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2445  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
300 aa  569  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.00641029 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.48 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  30.17 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  30 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3210  bile acid:sodium symporter  31 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  29.08 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  29.41 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  28.1 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  30.99 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  28.83 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  28.09 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1406  bile acid:sodium symporter  30.57 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  26.6 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  26.6 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  26.97 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  28.17 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  25 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  26.6 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  23.86 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  27.51 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  29.25 
 
 
335 aa  68.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  28.41 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  28.43 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  29.08 
 
 
329 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  28.14 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  24.19 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  26.06 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  27.21 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  27.21 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  26.15 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  23.23 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  27.68 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  25.34 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  25.75 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  28.09 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.82 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  26.12 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0440  bile acid:sodium symporter  25.86 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  25.82 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  25.08 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  28.37 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  27.34 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  27.08 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  27.36 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  30.71 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  25.46 
 
 
350 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  28.78 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  25.85 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  24.56 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  26.19 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  25.77 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  25.85 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  26.18 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  25.43 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  25.43 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  25.43 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  26.81 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  26.91 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  23.72 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  25.35 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.91 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  27.61 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  27.72 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  25 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0457  bile acid:sodium symporter  24.54 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  28.99 
 
 
435 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  24.22 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  24.89 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  25.97 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  27.98 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  28.85 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  25.55 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  24.48 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  34.96 
 
 
350 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  25.89 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  29.7 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  28.52 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  24.48 
 
 
349 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  27.2 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  36.36 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  24.06 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  29.92 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.15 
 
 
515 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  30.11 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  30.11 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  30.11 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  26.87 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  22.03 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  26.13 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  23.42 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  24.76 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  29.57 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  25.44 
 
 
438 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>