108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1406 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1406  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
317 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3210  bile acid:sodium symporter  73.94 
 
 
311 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0440  bile acid:sodium symporter  33 
 
 
314 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  29.28 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  29.28 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.57 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  26.91 
 
 
321 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  27.87 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  23.26 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  27.64 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  27.65 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  27.56 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.4 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  27.27 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  27.7 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  29.04 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  24.1 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  25.98 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  30.06 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  27.92 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.34 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  28.79 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  25.7 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  24.26 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  24.59 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  24.59 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  25.7 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  24.26 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  29.35 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  31.64 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  31.13 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  29.22 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  24.34 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  25.34 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  24.52 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  25.09 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  24.31 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2445  Bile acid:sodium symporter  30.48 
 
 
300 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.00641029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  25.35 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  30.09 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  29.05 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  26.07 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  24.01 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  23.86 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.41 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  24.73 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  28.49 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  25.97 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  26.1 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  28.14 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  31.01 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  23.3 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  24.33 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  25.95 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  24.43 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  24.25 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2825  Bile acid:sodium symporter  26.54 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  24.59 
 
 
299 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  29.8 
 
 
435 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  26.26 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  28.99 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  24.63 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  26.87 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  27.44 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  26.07 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  27.98 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  23.11 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  25.23 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  24.35 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  29.6 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  25.23 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  24.91 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  25.23 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  26.86 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  25.23 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  26.35 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  32.26 
 
 
438 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  24.47 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  26.36 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.84 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  27.86 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  27.7 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  27.48 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0457  bile acid:sodium symporter  22.73 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  22.38 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  26.97 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  27.88 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  25.81 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  25 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  29.95 
 
 
320 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  25.76 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  24.64 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  25.45 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0673  lipoprotein transmembrane protein  27.06 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.74924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  25.38 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  29.45 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>