88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0440 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0440  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 314 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1406  bile acid:sodium symporter  33 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3210  bile acid:sodium symporter  37.33 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  26.21 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  25.82 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  26.82 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  25.27 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  24.21 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  23.4 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  26.13 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  26.4 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  23.19 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  23.66 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  26.07 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  26.07 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  24.19 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  26.07 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  22.18 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  23.41 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  23.41 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  25.9 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  22.38 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  25.74 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  26.5 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  23.85 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  26.86 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  25.86 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  24.21 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  24.71 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  24.9 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  23.74 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  26.83 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  23.43 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  24.42 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  23.86 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  23.68 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  22.31 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  27.47 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  25.43 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0457  bile acid:sodium symporter  23.31 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  24.07 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  24.68 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  24.48 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  28.57 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  23.18 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  24.91 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  25 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  22.46 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  25.24 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  22.09 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2445  Bile acid:sodium symporter  26.53 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00641029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  21.71 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  21.71 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  22.48 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2825  Bile acid:sodium symporter  29.24 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  27.71 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  25.6 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  24.15 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  24.07 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  20.83 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  21.84 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  26.47 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  22.22 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  20.72 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  20.93 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  21.77 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  26.49 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  21.77 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  21.96 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  21.52 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  22.76 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  20.91 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  22.86 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  25.27 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  21.84 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  21.84 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  29.09 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  27.44 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  26.59 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  25.51 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  23.53 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  20.88 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  25.52 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  22.63 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  24.75 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1523  bile acid:sodium symporter  27.03 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00707175  normal  0.90394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>