271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2153 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  100 
 
 
349 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  75.86 
 
 
352 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  74.78 
 
 
347 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0416  arsenical-resistance protein  77.68 
 
 
349 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1910  arsenical-resistance protein  76.45 
 
 
351 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000179597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  69.25 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  67.62 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0356  arsenical-resistance protein  64.24 
 
 
346 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1111  bile acid:sodium symporter  70.64 
 
 
345 aa  434  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  59.29 
 
 
356 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2709  bile acid:sodium symporter  62.9 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1152  arsenical-resistance protein  64.16 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  63.29 
 
 
350 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0959  arsenical-resistance protein  60.41 
 
 
344 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  55.27 
 
 
351 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3670  arsenical-resistance protein  52.72 
 
 
360 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  0.2686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  55.75 
 
 
339 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  55.62 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6303  arsenical-resistance protein  53.22 
 
 
344 aa  349  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  53.96 
 
 
345 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  50.55 
 
 
366 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  55.72 
 
 
354 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  54.52 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  54.97 
 
 
349 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  51.78 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  51.18 
 
 
354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3779  arsenical pump membrane protein, putative  54.87 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.567439  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0523  bile acid:sodium symporter  51.79 
 
 
344 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27289  normal  0.171222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  54.87 
 
 
340 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  51.32 
 
 
341 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  51.71 
 
 
351 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  47.13 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5378  arsenical-resistance protein  46.26 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0872  bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 
400 aa  325  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.973623  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0418  arsenical-resistance protein  55.82 
 
 
344 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0303  arsenite/antimonite exporter, ArsB like  46.65 
 
 
361 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00764186  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  52.05 
 
 
337 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3275  arsenical-resistance protein  45.53 
 
 
383 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3126  arsenite efflux pump ACR3  46.02 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5672  arsenical-resistance protein  48.1 
 
 
378 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3117  arsenical-resistance protein  44.83 
 
 
350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1518  arsenical-resistance protein  48.67 
 
 
357 aa  319  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.894233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7179  arsenical-resistance protein  45.95 
 
 
361 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2321  arsenical-resistance protein  45.4 
 
 
384 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3126  ACR3 family arsenite efflux pump  50.3 
 
 
350 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1938  multidrug-efflux transporter  47.13 
 
 
353 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2372  arsenical-resistance protein  45.4 
 
 
384 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000347723  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3856  arsenical-resistance protein  50 
 
 
350 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1449  bile acid:sodium symporter  47.94 
 
 
358 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.939169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0330  bile acid:sodium symporter  45.4 
 
 
354 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3663  bile acid:sodium symporter  48.08 
 
 
355 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0208  arsenical-resistance protein  48.24 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.768524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6563  putative arsenate-sodium symporter  46.96 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0958  arsenical resistance protein, putative  47.66 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0323  bile acid:sodium symporter  47.04 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3959  arsenical-resistance protein  46.61 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5599  bile acid:sodium symporter  47.52 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19467  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1526  bile acid:sodium symporter  45.24 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0616  bile acid:sodium symporter  45.13 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0520  arsenical-resistance protein  46.04 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5709  arsenical-resistance protein  47.67 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6328  arsenical-resistance protein  47.23 
 
 
356 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.128519  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2316  arsenical-resistance protein  46.75 
 
 
358 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.460752  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2882  arsenical-resistance protein  44.73 
 
 
396 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1963  arsenical-resistance protein  46.63 
 
 
362 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3118  arsenical-resistance protein  47.79 
 
 
342 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4071  arsenical-resistance protein  46.02 
 
 
350 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30680  arsenical-resistance protein  46.45 
 
 
357 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1282  arsenical-resistance protein  46.45 
 
 
358 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6163  arsenical-resistance protein  46.67 
 
 
357 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1346  sodium/bile acid symporter family protein  45.13 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.17677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1049  arsenical-resistance protein  46.02 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3713  arsenical-resistance protein ACR3  46.07 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547945  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4052  arsenical-resistance protein  46.43 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.815051 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0557  putative arsenical resistance protein  46.97 
 
 
356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0490  arsenical-resistance protein  46.75 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4214  arsenical-resistance protein  46.22 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438657  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  45.99 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4175  arsenical-resistance protein  46.02 
 
 
358 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0219012  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11311  arsenite efflux pump ACR3  50.3 
 
 
336 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0544357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0649  arsenical-resistance protein  45.45 
 
 
348 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.045154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1343  arsenical-resistance protein  44.99 
 
 
360 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.198617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2517  arsenical-resistance protein  44.99 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3825  arsenical-resistance protein  45.91 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.941857  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0700  bile acid:sodium symporter  44.99 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3866  arsenical-resistance protein  45.72 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3938  arsenical-resistance protein  45.91 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1426  ACR3 family arsenite transporter  46.45 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.653925  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  52.34 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0877  arsenical-resistance protein  45.72 
 
 
351 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0667  arsenical-resistance protein  45.14 
 
 
385 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1972  bile acid:sodium symporter  46.13 
 
 
350 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2186  arsenical-resistance protein  44.35 
 
 
349 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368686  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6065  arsenical pump membrane protein  45.43 
 
 
364 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1582  ACR3 permease  44.87 
 
 
357 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  51.16 
 
 
339 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0565  arsenical-resistance protein  42.67 
 
 
397 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.998655  normal  0.774064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0533  bile acid:sodium symporter  52.33 
 
 
339 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0103  arsenical-resistance protein  43.86 
 
 
350 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2038  arsenical-resistance protein  47.55 
 
 
356 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>