19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1523 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1523  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00707175  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3559  bile acid:sodium symporter  51.15 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.888103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000342585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  24.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  25.56 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  25.56 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  25.95 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  24.09 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  24.87 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  30.83 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0440  bile acid:sodium symporter  26.78 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  21.9 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  20 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  29.55 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  24.83 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  25.78 
 
 		 438 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0949  putative membrane protein of unknown function  24.86 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>