12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3559 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3559  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.888103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1523  bile acid:sodium symporter  51.15 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00707175  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0571  hypothetical protein  36.24 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000342585  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  23.08 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  32.38 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4227  hypothetical protein  27.89 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3596  hypothetical protein  24.48 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  22.83 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  24.05 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  23.08 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>