59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1354 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  100 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  63.14 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  49.28 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  34.77 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  42.05 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  33.71 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  33.57 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  29.67 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  30.91 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  30.29 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.47 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  31.82 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  28 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  30.66 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  30.41 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  28.72 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  30 
 
 		 320 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  28.09 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  28.28 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  31.7 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  26.05 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  30.81 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  25.75 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  27.38 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  26.58 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  27.68 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  28.63 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  26.67 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.94 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2445  Bile acid:sodium symporter  29.02 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00641029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  28.24 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  27.1 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  22.92 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  25.63 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  30.22 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  25.14 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  25.68 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  27.31 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  28.23 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.52 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  26.89 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  25.17 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  29.22 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  24.48 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  25.17 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  24.83 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  29.11 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  27.54 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  28.1 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  24.83 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25.17 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  25.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  31.47 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  23.61 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  26.32 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  24.48 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>