41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5669 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  100 
 
 		 314 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  85.38 
 
 		 289 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  30.69 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  32.35 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  28.32 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  34.72 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  30.43 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  29.46 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  26.51 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  30.64 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  28.71 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  31.01 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.58 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  34.35 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  27.06 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  34.35 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  27.42 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  25.84 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  25.88 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  34.11 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  37.7 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  28.1 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  33.33 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  25.79 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  26.13 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  27.63 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  29.31 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  27.94 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  29.25 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  26.19 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  22.56 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  31.85 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  25.44 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  26.47 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  28.83 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  30.7 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  30.91 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  27.16 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>