70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4216 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 282 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  33.74 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  38.3 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  32.06 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  31.33 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  31.84 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  29.56 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  33.18 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  29.06 
 
 		 450 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  31.82 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  24.44 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.72 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  32.48 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  29.87 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  30.13 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  24.57 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  22.64 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  22.64 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  24.16 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  27.36 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  27.62 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  24.26 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  25.42 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  32.03 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  28.36 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  30.57 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  27.81 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  27.81 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  27.81 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  23.95 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  27.22 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  23.57 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  25.83 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  26.95 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  24.55 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  28.07 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  26.74 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  23.51 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  27.1 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  24.91 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  26.14 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  26.97 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  24.24 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  29.37 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  21.9 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  30.9 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  22.7 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  26.57 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  31.62 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  25.75 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  24.75 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  26.03 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  24.81 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  22.18 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  23.48 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  27.46 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  25.34 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  22.18 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  25.72 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  22.6 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  23.85 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  21.48 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  25 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  21.7 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 683 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  25.84 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  22.92 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  22.18 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  23.43 
 
 		 356 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>