33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3238 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
293 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  50 
 
 
278 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  49.28 
 
 
278 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  42.97 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  31.93 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  34.01 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  31.33 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  33.56 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  29.22 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  29.23 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  31.38 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  29.74 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  29.9 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  27.74 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  29.23 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  25.52 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  27.16 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  27.69 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  28.14 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  31.25 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  24.76 
 
 
292 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25.2 
 
 
389 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  26.44 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  25.1 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  27.31 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  23.95 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.1 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  27.4 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  27.06 
 
 
291 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>