116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1377 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  100 
 
 
277 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  44.98 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  42.97 
 
 
293 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  41.18 
 
 
280 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  43.73 
 
 
278 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  42.05 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  36.47 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  31.2 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  30.52 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  31.37 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  30.52 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  28.81 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  25.23 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  27.39 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  30.47 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  26.75 
 
 
303 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  27.19 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  26.75 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  26.75 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  27.23 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  27.23 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  27.23 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  28.63 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  26.46 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  28 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  26.69 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  23.71 
 
 
291 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  28.7 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  26.09 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  27.56 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  27.8 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  29.29 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  36.3 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  31.54 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  29.24 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  31.9 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  28.02 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  25.62 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  31.82 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  31.61 
 
 
356 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  27.93 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  29.94 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  31.88 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  28.81 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  30.51 
 
 
335 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  31.16 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2445  Bile acid:sodium symporter  33.08 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.00641029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  31.25 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  27.13 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  25.26 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  26.61 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  30.99 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.91 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  28.14 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  24.27 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17829  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.38 
 
 
351 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336169  normal  0.02899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  29.38 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  26.44 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  24.82 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  28.87 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  21.79 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  24.65 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  27.56 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  28.79 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  28.12 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  35.64 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.05 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  29.05 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  24.56 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  27.76 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.91 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  27.41 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  26.82 
 
 
321 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  24.07 
 
 
320 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  30.91 
 
 
301 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  27.76 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  18.97 
 
 
368 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  26.19 
 
 
322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  26.19 
 
 
322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  28.57 
 
 
381 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  34.62 
 
 
309 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  22.99 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  29.05 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.69 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  26.4 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  28.57 
 
 
381 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  24.15 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  24.15 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  24.9 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 
321 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  25 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  25.84 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  28.68 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  26.4 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  29.58 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  28.67 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>