105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17829 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_17829  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  100 
 
 
351 aa  701    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336169  normal  0.02899 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34425  predicted protein  36.87 
 
 
358 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49978  predicted protein  38.32 
 
 
526 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  25.16 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  26.89 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44951  predicted protein  46.81 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  26.29 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  27.41 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  28.29 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  28.29 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  28.57 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  26.95 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  27.12 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  26.44 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  30.04 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  32.89 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  27.02 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  29.39 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  27.8 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  27.76 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  29.63 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  24.15 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  24.31 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  29.54 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  28.62 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  25.63 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  25.29 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  26.97 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  26.17 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  24.28 
 
 
293 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  28.51 
 
 
321 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  28.63 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  21.05 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  24.05 
 
 
296 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  29.18 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  32.74 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  24.05 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  28.02 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  32.32 
 
 
325 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  26.48 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  26.34 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  25.61 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.52 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  20.65 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  26.09 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  26.09 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  28.33 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  25.69 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  25 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  27.2 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  22.61 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  28.11 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  26.09 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  26.09 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  30.77 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  25.97 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  25.2 
 
 
344 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  31.19 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  23.91 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  24.5 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  25.41 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  26.07 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  25.69 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  25.2 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  22.9 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  25.2 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  23.28 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  24.44 
 
 
299 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  23.28 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  25.51 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  30.54 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  35.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  25.56 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  36.46 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  23.44 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  27.31 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  25.52 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  24.26 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  23.51 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  23.39 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  21.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  31.82 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  24.9 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  21.37 
 
 
303 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  21.37 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  21.37 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  23.67 
 
 
309 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  26.94 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  26.71 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  28.87 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  30.21 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>