37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1200 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  100 
 
 		 450 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  43.7 
 
 		 139 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  42.98 
 
 		 134 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1198  protein of unknown function DUF202  43.01 
 
 		 137 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1463  protein of unknown function DUF202  34.68 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  39.42 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1644  hypothetical protein  31.08 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.515624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  26.77 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  27.93 
 
 		 123 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19491  sodium dependent transporter  30.95 
 
 		 284 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  30.47 
 
 		 277 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  25.81 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  32.35 
 
 		 153 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  22.27 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  30.12 
 
 		 110 aa  50.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  38.36 
 
 		 123 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  27.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  25.42 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  25.42 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  34.83 
 
 		 125 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  32.94 
 
 		 100 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  23.62 
 
 		 284 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59170  predicted protein  26.67 
 
 		 116 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.273554 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  34.78 
 
 		 149 aa  46.6  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  24.68 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  28 
 
 		 126 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  27.84 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  22.73 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  26.71 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  27.84 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  24.39 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  26.36 
 
 		 292 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  27.84 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  23.17 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>