28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2917 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  39.34 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  43.22 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  39.84 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  35.29 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  43.69 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  34.45 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  34.45 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 
217 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  36.25 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  39.24 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  46.77 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  32.76 
 
 
450 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  35.71 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  33.61 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  34.51 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  28.95 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  31.67 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  42.37 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  30.93 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  30.93 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  32.94 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  52.63 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  53.12 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  34.83 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>