27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5020 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  72.73 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  67.42 
 
 
147 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  64.23 
 
 
144 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  63.93 
 
 
144 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  39.45 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  32.59 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  43.59 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  27.83 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  35.23 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  33.02 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  35.63 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  36.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  34.19 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  27.59 
 
 
128 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  32.56 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  32.56 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  30.1 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  31.4 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  26.32 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  29.89 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  31.86 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  31.11 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  26.23 
 
 
139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  24.58 
 
 
121 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  30.69 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>