27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2846 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  71.83 
 
 
145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  67.42 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  63.85 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  62.31 
 
 
144 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  34.55 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  26.45 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  33.03 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  28.69 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  28.91 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  36.71 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  31.09 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  34.88 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  27.41 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  27.41 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  22.61 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  31.03 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  25.23 
 
 
126 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  30.34 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  24.51 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  23.33 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  29.29 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  28.8 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  20.37 
 
 
450 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>