27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2586 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  72.73 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  71.83 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  58.21 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  56.72 
 
 		 144 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  25.74 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  39.74 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  29.66 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  33.71 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  29.63 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  34.18 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  27.52 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  30.93 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  30.86 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  35 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  45.95 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  30.89 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  23.76 
 
 		 217 aa  42.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  25.49 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  22.31 
 
 		 450 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  23.39 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  46.67 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  29.33 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  29.33 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>