35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4468 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
144 aa  289  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  98.61 
 
 
144 aa  285  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  63.93 
 
 
141 aa  160  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  58.21 
 
 
145 aa  158  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  63.85 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  29.75 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  30.71 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  30.43 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  35.8 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  33.88 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  27.35 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  36.11 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  40.96 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  36.36 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  27.21 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  27.21 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  29.46 
 
 
217 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  28.4 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  32.23 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  26.47 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  28.99 
 
 
139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  32.38 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  22.73 
 
 
450 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  35.24 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0462  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  30.93 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  36.56 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  26.02 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  31.15 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  35.48 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  37.5 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>