23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1199 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
139 aa  286  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  46.77 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  43.7 
 
 
450 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1198  protein of unknown function DUF202  36.92 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  35.07 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1463  protein of unknown function DUF202  36.04 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  31.86 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  29.71 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  31.06 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  28.99 
 
 
144 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  30.43 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  26.61 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  26.61 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  29.9 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  32.05 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  32.56 
 
 
100 aa  43.5  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  28.45 
 
 
130 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  26.23 
 
 
141 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  28.16 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  41.94 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  60.71 
 
 
139 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>