44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1270 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  53.7 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  37.84 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  40.52 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  42.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  37.08 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  31.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  35.92 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  28.69 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  31.54 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  48.44 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  55 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  36.45 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  31.71 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  27.21 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  26.47 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  36.05 
 
 		 120 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  37.35 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  46.27 
 
 		 100 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  57.14 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  27.5 
 
 		 122 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  27.36 
 
 		 450 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  29.63 
 
 		 123 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  27.83 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  52.38 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  36.23 
 
 		 139 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00580  DUF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11150)  33.73 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.529613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  57.58 
 
 		 111 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  26.61 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  30.21 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  36.76 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  56.76 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  25.93 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  56.25 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  54.05 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  30.21 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  54.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  48.65 
 
 		 140 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  56.67 
 
 		 120 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  51.43 
 
 		 128 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>