20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2128 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
123 aa  244  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  43.8 
 
 
125 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  40.68 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  38.84 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  36.7 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  40.43 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  48.44 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  48.44 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  53.66 
 
 
217 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  27.93 
 
 
450 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  36.13 
 
 
110 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  31.86 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  58.82 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  46.03 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  39.68 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  30.51 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  35.8 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  30.28 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  48.57 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>