42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0982 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  53.7 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  53.7 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  37.84 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  37.76 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  34.21 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  32.04 
 
 
147 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  34.09 
 
 
125 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  32.69 
 
 
153 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  26.17 
 
 
130 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  36.25 
 
 
111 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  28.97 
 
 
139 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  58.97 
 
 
124 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  53.66 
 
 
123 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  26.77 
 
 
450 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  28.1 
 
 
120 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  48.08 
 
 
129 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  29.46 
 
 
144 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  29.46 
 
 
144 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  28.46 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  31.82 
 
 
120 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  57.14 
 
 
131 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  33.66 
 
 
149 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  44.64 
 
 
134 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  61.29 
 
 
123 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  29.89 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  37.35 
 
 
128 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  38.75 
 
 
100 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  23.76 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  28.18 
 
 
122 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  43.4 
 
 
133 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  48.72 
 
 
111 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  48.72 
 
 
128 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  45.45 
 
 
139 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  51.28 
 
 
128 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  30.43 
 
 
139 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  56.25 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  60 
 
 
120 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  23.76 
 
 
145 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  29.07 
 
 
107 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>