68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0154 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
120 aa  235  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  51.79 
 
 
129 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  44.55 
 
 
111 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  43.86 
 
 
123 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  51.02 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  53.12 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  57.47 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  44.14 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  43.52 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  78.57 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  46.25 
 
 
117 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  49.35 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  56.41 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  68.89 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  45.05 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  41.74 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  48.31 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  49.35 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  50 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  43.62 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  37.04 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  37.17 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  54.1 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  41.77 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  51.79 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  37.14 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  37.14 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  37.14 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  37.14 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  43.88 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  33.64 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  36.75 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  44.3 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  47.37 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  82.35 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  46.74 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  40.74 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  46.75 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  32.11 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  32.11 
 
 
217 aa  52.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  34.51 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  34.51 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  45.78 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  39.05 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  32.48 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  42.17 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  37.25 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00125  hypothetical protein  52.83 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  32.43 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  38.55 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  35.44 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  32.43 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>