62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  47.62 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  58.89 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  58.89 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  58.89 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  50.96 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  50.96 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  50.96 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  50.96 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  56.67 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.08 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  55.68 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  45.22 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  56.96 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  45.19 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  47.32 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  42.86 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  45.28 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  55.95 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  44.25 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  43.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  48.18 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  41.9 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  43.81 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  46.25 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  47.83 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  54.05 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  45.24 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  40.95 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  55.56 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  39.34 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  43.52 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  48.35 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  48.65 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  47.12 
 
 		 104 aa  66.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  39.74 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  42.16 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  48.19 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  40.54 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  42.17 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  53.73 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  64.71 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  29.73 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  46.91 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  53.66 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  36.49 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  34.86 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  30.7 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01334  vacuolar transporter chaperon Vtc1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09540)  36.79 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  45.24 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>