65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1696 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  270  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  65.08 
 
 
133 aa  151  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  69.83 
 
 
131 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  63.74 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  58.51 
 
 
130 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  63.64 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  53.76 
 
 
128 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  49.09 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  45.3 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  47.83 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  48.54 
 
 
123 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  41.9 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  52.63 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  52.17 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  42.45 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  48.39 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  42.86 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  51.11 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  48.96 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  41.82 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  51.85 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  47.25 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  40.19 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  52.17 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  45.05 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  46.81 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  46.81 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  46.81 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  46.81 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  37.4 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  52.94 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  43.75 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  42.99 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  51.43 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  40 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  40.3 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  45.28 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  54.05 
 
 
217 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15281  predicted protein  32.05 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.002411  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  38.38 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  48.65 
 
 
217 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  48.65 
 
 
217 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  51.52 
 
 
110 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3875  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808516  normal  0.287534 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  32 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  35.29 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  55.88 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00125  hypothetical protein  40.85 
 
 
116 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>