64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1719 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  253  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  82.64 
 
 
133 aa  178  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  69.83 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  62.86 
 
 
139 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  64.04 
 
 
134 aa  106  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  60.76 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  47.75 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  49.41 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  48.75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  54.22 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  52.63 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  50.56 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  52.44 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  47.46 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  47.46 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  47.46 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  38.68 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  52.44 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  44.83 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  54.02 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  48.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  51.25 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  43.75 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  40.95 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  45.71 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  48.6 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  40.57 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  38.89 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  40.57 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  40.57 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  40.57 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  40.57 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  45.78 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  39.06 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  43.37 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  46.34 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  40.31 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  47.25 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  41.35 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  39.25 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  55.84 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  47.42 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  57.14 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15281  predicted protein  30.39 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.002411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  40.51 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  40.51 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  34.88 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  37.74 
 
 
131 aa  43.9  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  32.17 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  60.61 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  37.33 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>