70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0978 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  236  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  89.38 
 
 
117 aa  199  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  89.38 
 
 
117 aa  199  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  89.38 
 
 
117 aa  199  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  87.61 
 
 
117 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  45.71 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  49.52 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  50.45 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  45.63 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  48.28 
 
 
130 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  48.08 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  47.12 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.54 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  46.53 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  46.53 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  46.53 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  46.53 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  51.69 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  54.29 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  50.57 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  47.79 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  56.25 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  55.56 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  47.66 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  49.38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  47.17 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  46.85 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  53.93 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  50.6 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  41.84 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  51.28 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  43.52 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  57.5 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  53.66 
 
 
122 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  46.67 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  43.01 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  45.45 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  51.9 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  39.74 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  47.37 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  53.01 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  36.29 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  73.68 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  46.67 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  36.11 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  33.57 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  28.46 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  37.5 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  36.63 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  86.36 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  31.78 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  29.59 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48538  predicted protein  31.93 
 
 
1027 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59170  predicted protein  32.14 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.273554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  48.78 
 
 
128 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  30.56 
 
 
141 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  44.23 
 
 
131 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00125  hypothetical protein  63.33 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  65.38 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>