59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1610 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  255  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  66.4 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  30.25 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  33.88 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  31.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  31.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  31.53 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  33.02 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  30.71 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  34.91 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  42.39 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  34.25 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  28.46 
 
 		 217 aa  50.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  29.29 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  33.62 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  35.53 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  39.47 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  28.87 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  34.86 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  29.9 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  31.62 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  34.48 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  34.65 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  40.51 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  38.1 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  54.35 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  30.77 
 
 		 131 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1463  protein of unknown function DUF202  33.78 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  44.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  29.41 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  67.86 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  35.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 450 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  38.16 
 
 		 125 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>